Mitjançant ISA2 la Comissió perseguix continuar l'esforç del Programa ISA 
(Solucions d'interoperabilitat per a les administracions públiques europees), en vigor des de 2010 fins a 2015. ISA2 seguix la senda del camí recorregut pels programes anteriors ANADA, IDABC i ISA per a recolzar la cooperació entre administracions públiques al servici d'actes i polítiques comunitàries, sobre la base d'un ús eficaç i eficient de les tecnologies de la informació per a l'establiment de servicis públics transfronterers, contribuint a eliminar barreres a les interaccions transfrontereres per motiu de falta d'interoperabilitat i de solucions comunes, segons s'explica detalladament en ‘ Els servicis públics europeus d'Administració electrònica’ .
L'assoliment de la interoperabilitat entre les administracions està considerat en la Unió Europea com un aspecte essencial per a millorar l'eficiència i l'eficàcia de la prestació dels servicis, alhora que compartir i reutilitzar les solucions d'interoperabilitat ja existents pot ajudar a contindre la multiplicació de costos. Este paper rellevant de la interoperabilitat vé recollit en Agenda Digital per a Europa , l'estudi estudi anual sobre el creixement de 2013 , les conclusions del consell d'octubre de 2013 , entre altres referents.
El nou programa ISA2 és necessari per a facilitar la cooperació entre els Estats membres i la Comissió; cartografiar i analitzar el panorama general de la interoperabilitat a Europa; permetre, promoure i recolzar un enfocament holístico respecte de la recollida, avaluació, desenvolupament, establiment, industrialització, funcionament, millora i manteniment de les solucions d'interoperabilitat, incloses les solucions que faciliten la reutilització de les dades i el seu intercanvi, amb la finalitat de recolzar la interacció transfronterera o intersectorial entre les administracions públiques europees, les empreses i els ciutadans; i al mateix temps, promoure i recolzar la reusabilitat, integració i convergència de les solucions existents, incloses les derivades d'altres àmbits de les polítiques de la UE.
ISA2 s'alinearà amb altres iniciatives comunitàries com el Programa CEF (Connecting Europe Facility) i l'European European Cloud Initiative ; a més, contribuirà a la interoperabilitat en àrees tals com a mercat interior, medi ambient, justícia, duanes, fiscalitat, sanitat, salut alimentària, fons europeus, informació del sector públic, identitat electrònica, estandardització TIC, estadística i contractació pública.
El valor aportat per ISA2 es materialitzarà la reducció dels temps de resposta en la interacció entre administracions i amb els ciutadans i les empreses; la identificació i la reutilització de solucions existents per a necessitats comunes; l'automatització de transaccions transfrontereres i entre sectors contribuint a l'estalvi de recursos i temps.
